La explotación petrolera conlleva de manera implícita una contaminación al medio ambiente, lo cual demanda el desarrollo de estrategias innovadoras de biocatálisis y biorremediación ambiental. En la Amazonía ecuatoriana, una región de alta fragilidad y vulnerabilidad ambiental debido a su inconmensurable biodiversidad, la actividad petrolera ocasiona una fuente permanente de contaminación que incluye la generación de ingentes cantidades de aguas y suelos contaminados con hidrocarburos recalcitrantes de difícil manejo, entre otros pasivos ambientales. Las reservas de hidrocarburos ubicadas en esta región se caracterizan por tener una alta concentración de asfaltenos, fracción de mayor polaridad y peso molecular que compone el petróleo crudo, los cuales poseen una baja biodisponibilidad para ser degradados por los microorganismos. Por ello, la presente investigación tiene como finalidad conocer la biodiversidad de microorganismos hidrocarbonoclásticos presentes en emanaciones naturales de asfalto en la región amazónica ecuatoriana, tales como las encontradas en la cantera de Pungarayácu, Provincia de Napo. Se propone el uso de exoenzimas extracelulares provenientes del sistema enzimático de degradación de lignina presente en hongos ligninolíticos para ser empleados en nuevas estrategias sustentables de biorremediación de suelos contaminados con hidrocarburos recalcitrantes. Así mismo, se plantea estudiar la potencial interacción que pudiera tener la diversidad de hongos presentes en las emanaciones naturales de asfalto con la diversidad de bacterias degradadoras de hidrocarburos empleando técnicas de secuenciación masiva de ADN de nueva generación (NGS). Se espera obtener biocatalizadores autóctonos promisorios capaces de degradar la fracción más recalcitrante del petróleo y que sean capaces de sobrevivir en condiciones ambientales extremas.